Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ctdsp2Q8BX07 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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