Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Zfp398Q8BV16 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp398Q8BV16 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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