Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pggt1bQ8BUY9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pggt1bQ8BUY9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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