Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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