Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Zbed4Q80WQ9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed4Q80WQ9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms