Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp8Q80U87 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms