Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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