Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1cQ7TSF0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms