Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6aQ78XR0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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