Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sys1Q78S06 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sys1Q78S06 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms