Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms