Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trim37Q6PCX9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trim37Q6PCX9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trim37Q6PCX9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trim37Q6PCX9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim37Q6PCX9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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