Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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