Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms