Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms