Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TroQ6DIC6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms