Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Pkp4Q68FH0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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