Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ctnna3Q65CL1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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