Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa17Q64016 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa17Q64016 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms