Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms