Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Trim28Q62318 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim28Q62318 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Trim28Q62318 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim28Q62318 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim28Q62318 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim28Q62318 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim28Q62318 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Trim28Q62318 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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