Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sall3Q62255 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms