Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rbm38Q62176 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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