Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ifi47Q61635 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ifi47Q61635 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms