Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mre11Q61216 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mre11Q61216 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mre11Q61216 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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