Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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JrkQ60976 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
JrkQ60976 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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