Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Traf3Q60803 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Traf3Q60803 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Traf3Q60803 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Traf3Q60803 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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