Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms