Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtprnQ60673 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprnQ60673 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtprnQ60673 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprnQ60673 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms