Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms