Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bod1Q5SQY2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms