Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms