Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms