Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms