Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Spire1Q52KF3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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