Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc43Q3V0L5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms