Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim80Q3V061 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trim80Q3V061 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim80Q3V061 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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