Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm29609Q3UU56 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm29609Q3UU56 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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