Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm6899Q3USS0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm6899Q3USS0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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