Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms