Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms