Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc34Q3UI66 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms