Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gm5113Q3UGK8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5113Q3UGK8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms