Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms