Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnf180Q3U827 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms