Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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