Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms