Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms