Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms