Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms